私はため息でこれを言っているでしょう
どこかの年齢そしてそれ故に年齢：
森の中で二本の道が分かれていて、そして私は――
私は、以下で走行1を取りました
そしてそれがすべての違いを生み出しました。
ロバートフロスト
私は正統派の科学者として生まれ、従来の学問の約束のベルトに放り出されました。母は 著名な分子生物学者であり指導者 彼は幼い頃から私の科学的好奇心を育み、夕食のテーブルを囲みながら細胞について説明し、私がまだ5歳のときに二酸化炭素を糖と酸素に変える光合成の触媒作用の話を聞かせてくれた。
「二酸化炭素とは何ですか？」と私は尋ねます。
「いい質問ね！」と母は、伝染するような熱意で叫んだものだ。「宇宙全体、つまりあなたが見たり、感じたり、触れたりするものはすべて、原子でできているのよ…」母は私の腕をつかんで言った。「皮膚を拡大してみると、細胞と呼ばれる生きた泡でできているのがわかるわ。細胞を拡大してみると、さらに小さな分子と呼ばれるもの ― 脂肪、タンパク質、糖、核酸 ― でできているのがわかるわ。そして分子を拡大してみると、原子と呼ばれる構成要素でできているのがわかるわ。二酸化炭素は分子で、炭素原子1個と酸素原子2個でできているわ。私たちが呼吸する空気のほとんどは二酸化炭素でできている…息を吸うときは酸素を吸い込み、息を吐くときは二酸化炭素を吐き出している…」母は、私が吐く空気と植物が吸い込む空気、そして私がシリアルで食べた糖分を結びつけて話を続けてくれた。
聡明な母のもと、生まれながらの科学の才能に恵まれていた私は、言うまでもなく学校の成績も優秀でした。勉強するもの全てが好きで、生物学と応用数学の二つの学位を取得し、化学と心理学を副専攻するところでした。学部生時代には研究に取り組み、権威ある全米科学財団大学院研究フェローシッププログラムに合格しました。博士課程にも数多く応募し、ハーバード大学、スタンフォード大学、プリンストン大学など、数多くの大学に合格しました。プリンストン大学では、著名な指導教官であるサイモン・レビン博士の指導の下、わずか4.5年半で博士号を取得し、その後デューク大学でポスドク研究員として研究しました。
私は学問の正統派の道を歩み続け、2017年からコウモリウイルスの流出を研究するDARPA資金提供チームに所属しました。私は、一緒に働いていたチームがコウモリヘニパウイルスの流出を予測し、これらの危険なウイルスの出現を未然に防ぐことを目的とした、成功したDARPA PREEMPT助成金の申請を手伝いました。 私は論文を発表しました数学と生物学の両分野において、革新的な新手法を次々と開発しました。私は、過去の学者の肖像画が並ぶアカデミーのホールへと続く、サクラソウの小道をたどり、ホールの突き当たりに自分の肖像画が飾られることを強く期待していました。
それは昔の話だ。2019年に私が見下ろしていた正統の道は今や霧に覆われ、荘厳な広間や肖像画は炎に呑み込まれ、学問の夢は消え去った。
何が起こったの？どこで間違えたの？
どの時点で、私はあまり通っていない道を選んだのだろうか?
私の異端の罪
科学者として、私は観察したものを、時間と因果関係という具体的な単位、つまり謎や理由を解明できる可能性のある出来事の集合へと分解せざるを得ません。一つ一つの出来事を個別に理解できれば、一連の出来事の混乱もより理解しやすくなるかもしれません。
新型コロナウイルス感染症のパンデミックは、私の正統的な自己イメージの終焉の始まりでした。一連の出来事を通して、私が型破りな人間であることを明らかにし始めました。そして、これらの出来事を通して、私は自分が型破りな人間であることを自覚しただけでなく、学界が型破りな人間に冷淡であることをも悟りました。以下は、私が経験した興味深い出来事、私が取った型破りな立場、そして受けた扱いについてです。
パンデミックの予測
2020年XNUMX月下旬からXNUMX月上旬にかけて、私は武漢の症例増加率、PCR検査の偽陰性率が高いとする症例報告、非特異的な症状を伴う伝染の典型的なバイエルン州の症例研究などを分析し、パンデミックは避けられないと信じるに至った。私の症例増加率の推定ははるかに速く、疫学では一般的に用いられない方法で在庫の増加率を推定した経験があったため、私の方法は従来の方法とは異なっていた。症例増加率が速いほど、推定される有病率は高くなり、より大きな無臨床症例の氷山に対する信頼性が高まり、武漢関連の地域でのアウトブレイク発生の推定日が遅れ、旅行者スクリーニングによってパンデミックを阻止できる可能性は低下し、パンデミックの可能性は高まった。
2～3日の倍加時間という私の研究結果を、DARPA PREEMPTチームの研究者たちに伝えようとしたのですが、オックスフォード大学の教授が、私の話を聞いている暇などないと言い放ったのが印象的でした。彼は端的に言って、「モンタナのポスドク」よりも、ハーバード大学、インペリアル・カレッジ・ロンドン、ロンドン衛生熱帯医学大学院のチームをはるかに信頼しているのです。これらの大規模研究機関は、いずれも倍加時間を6.2日、低い無症状率、そして高い封じ込め成功率と推定しているため、チームメイトである彼は、彼らの実績だけでは、私の異端説に付き合う時間などありませんでした。私の周囲にいる他の研究者も同様に反対で、ある教授は、もし私が研究結果を共有し、それが間違っていたら、Fox Newsに取り上げられ、油断を招き、何百万人もの死に直接関わることになるかもしれないと主張しました。
この一件では、私は研究結果を非公開にすることを選択しました。これは世界が耳にしなかった警告だと、異端のカサンドラは言い放ち、彼らは疫学者ではないと告げ、自分の専門分野にとどまるよう圧力をかけられました。これらの研究結果は、迫り来るパンデミックを人々に知らせるどころか、ヘッジファンドが市場を空売りするのに利用されたのです。
インフルエンザ様疾患（ILI）に関する論文
私は、有病率が高く、増加率も速いと考えていたため、2020年XNUMX月からXNUMX月までにニューヨーク市などの米国の大都市圏で医療を求める患者が急増するだろうという仮説を立てました。この数学的な先見の明の結果、ジャスティン・シルバーマン、ナサニエル・ヒューパート、そして私は、インフルエンザ様疾患（ILI）でセンチネルプライマリケア提供者を受診する患者の割合を報告するCDCのインフルエンザ様疾患データセットを監視し、状況を把握し続けました。
2020年8月には、患者数が急増したことがわかりました。このILI患者の割合の急増を、実際の患者数に換算すると100,000万人の超過患者となり、当時記録されていたXNUMX万人未満の症例をはるかに上回りました。私たちの論文は 選んだ人 当学校区の エコノミストするとすぐに、私たちは（無作為な荒らしではなく）同僚の科学者たちから攻撃を受け、公衆衛生メッセージを妨害し、COVID-2020を軽視し（感染者数が多いほど死亡者数は少なくなるため）、人々の自己満足を招いていると非難されました。私の職場内でも、XNUMX年XNUMX月の私の研究結果を共有することを阻止した科学者の中には、TwitterやSlackチャンネルでさらに攻撃を仕掛け、私を批判したり、科学コミュニティに所属しようとする私の努力を阻んだりする機会を何度も見つけました。
2020年秋の予測
私の理論によれば、パンデミックと、ニューヨーク市の医療機関全体でICU入院患者数が2020日間で倍増した2年2020月の急増を予測した理論によれば、ニューヨーク市でのXNUMX年XNUMX月からXNUMX月にかけての急増は、感染しやすい人口の減少、つまりコロナ以前は「集団免疫」と呼ばれていた人口の状態によって終息した可能性が高い。
もしこれが真実なら、将来のアウトブレイクをニューヨーク市のアウトブレイクと比較し、将来のアウトブレイクではニューヨーク市と同様の人口致死率で症例がピークを迎えることがわかるはずです。ジャツィン・シルバーマンと私は、ニューヨーク市のカーブと比較するためにアウトブレイクを監視するダッシュボードを開発しました。そして2020年の夏には、多くの抑制されていないアウトブレイクが「ニューヨーク市ライン」を裏付けているのを確認しました。以下の図は理解するのに少し時間がかかりますが、基本的には時系列データです。 負担のタイムスケールこれにより、異なる日に発生したアウトブレイクの成長率を同様の負担で比較することが可能になります。
2020年1月、私はこれらの調査結果をCDCの予測チームと共有し、将来の感染拡大の背景を説明しました。米国の感染拡大で、感染者数が人口1,000人あたり2020人の死亡者数でピークを迎えた場合、XNUMX年XNUMX月から私が展開してきた理論が、その理由を集団免疫によって説明できるだろう、というものです。
2020年秋に米国全土で発生したアウトブレイクは、特に新型コロナウイルス感染症の蔓延をほとんど抑制できなかった州や郡で発生したアウトブレイクにおいて、「ニューヨーク市ライン」がアウトブレイクの強度（スピードと負担の両方）の上限の四分位であることを普遍的に裏付けました。
ワクチンの到着前、米国の11郡における症例数のピーク時の人口致死率（D(t+3,000)）は、すべてニューヨーク市のラインに収束しました。このピークは、従来のモデルにおける4倍の重症化を示す破線シナリオよりも異常に低い値です。
私はこの発見を美しく照らし出す美しい図を作成しました。しかし、2020年の秋に グレートバリントン宣言 （GBD）は、私たちのモデルがパンデミックの深刻さを過大評価している可能性があり（私の調査結果もこれを示唆しています）、封じ込め政策が悪影響を及ぼす可能性があることを指摘して執筆されました。GBDは「集団免疫」戦略と呼ばれていましたが、著者は集団免疫について言及していませんでした。しかし、個人的には、2020年秋のアウトブレイクは集団免疫によってピークを迎えたと考えています。これは、アウトブレイクがニューヨーク市ラインに収束したことからも明らかです。以下は、ワクチンが到着するずっと前から、米国の3,000を超える郡すべてで発生したアウトブレイクが、従来の推定よりもはるかに少ない負担で、ニューヨーク市ラインの下でピークに向かっていると推定される相図です（破線で示されています）。
2020年1月、ポスドクの指導教官は私に研究結果の公表を控えるよう要求しました。彼女は、集団免疫に関する私の主張が州政府との関係に悪影響を及ぼすのではないかと懸念していました。州政府は、大学構内の住民を対象とした検査・追跡実験を行うために彼女にXNUMX万ドルを支給していたからです。私の理論では、そのような実験は不要でした。私の理論では、州政府は、非集合住宅や医療へのアクセスが不足している部族や農村地域に資源を配分すべきであり、大学生を隔離する実験に手を出すべきではありません。
私はこれらの意見の相違からモンタナ州立大学の職を辞したが、最終的にはコロナ関連の短編から学んだ教訓を生かした。自分の専門分野で何かを見て何かを言うことが慣習に反するのであれば、自分の研究結果を共有せずに世界が準備不足の無知に苦しむのを見ているよりは、研究結果を共有して批判されるほうがましだ、という教訓だ。
ジョン・イオアニディスの弁護
ジョン・イオアニディス博士はスタンフォード大学の著名な教授です。彼は新型コロナウイルス感染症のパンデミック初期に論文を発表し、私たちは不確実性の中で意思決定を行っており、私たちの政策は害を及ぼす可能性があり、パンデミックは従来のチームが予測したほど悪くないかもしれないと主張しました。
イオアニディス博士は、Twitterで声高に批判する学者から非難を浴びました。彼らはイオアニディス博士を矮小化する人物だと考え、あらゆる機会を利用して彼を批判しました。
イオアニディス博士はかつて、Twitterのフォロワー数が多い研究者は、実際にはそれほど多くの論文や引用文献を持っていないことを発見した論文を発表しました。つまり、Twitterで「専門家」を自称する人々は、実際には専門知識を求めるのに最適な人物ではない可能性があるということです。イオアニディス博士はTwitterのハンドルネームを使って論文を発表しましたが、多くの研究者がTwitterのハンドルネームを使って論文を発表することは非倫理的であり、IRBの規則に違反し、科学者が標的にされる可能性のある一種のハラスメントであると主張する運動を開始しました。
私は反対意見を述べました。このルールは作り話だと主張しました。Twitterのハンドルネームは公開データであり、IRB（研究審議会）がパブリックドメインのデータを分析・公開する必要はない、と。さらに、ジョン・イオアニディス氏を科学者へのハラスメントで批判している人々の多くは、MITのグループが「反マスク派」とラベル付けしたハンドルネームを公開していることを広く共有し、支持していました。もしここで倫理的な問題があるとすれば、それはイオアニディス氏を攻撃するために研究倫理への憤りを恣意的に作り出したことであり、科学者が図表の中で反マスク派と色付けした人々に「反マスク派」のような軽蔑的なレッテルを貼ることの倫理性に疑問を呈している、と主張しました。
免疫力の低下
2020年秋の感染拡大が集団免疫閾値でピークに達したという仮説に基づくと、その後の感染拡大を説明できる唯一の方法は、免疫力の低下と免疫回避の組み合わせによるものである。
ロンドン衛生熱帯医学大学院のチームと協力し、懸念される最初の変異株であるアルファの解明に取り組むことで、私は正統派の道を少しだけ歩み始めました。当時私はヘッジファンドでSPAC（特別買収会社、基本的にはIPOのためのプライベートエクイティビークル）を分析しており、 B.1.1.7の伝播性に関する「IPO」または「初期系統学的観察」分析.
しかし、私の理論では、アルファ波は、より早期に感染が拡大した地域、おそらく2020年秋の感染者急増が少なかった地域で、より大きな波を引き起こすと予想されます。まさにそれが実際に起こり、免疫力の低下の証拠となりました。
残念ながら、この発見当時、免疫力の低下は誤情報とみなされていました。免疫力の低下は、ワクチンによって誘発された免疫力も低下する可能性があることを示唆していたからです。もし自然免疫とワクチンによって誘発された免疫力が低下すれば、6年秋のアウトブレイクから2020ヶ月後に米国で感染者急増が見られると予想されます。そして、これらの後続のアウトブレイクにおける感染率は、これらのアウトブレイクにおける累積的な感染負荷と最も負の相関を示し、ワクチン接種率とは負の相関を示しません。実際、2021年XNUMX月までに、私たちはまさにその状況を確認しました。
免疫力が衰えれば、ワクチン接種を義務付ける政策の費用対効果は変化します。2020年秋のアウトブレイクが自然な集団免疫閾値に達しておらず、免疫力が衰えないのであれば、ワクチン接種の義務化は正当化されるかもしれません。しかし残念ながら、私の理論的な観点からすると、2020年秋のアウトブレイクは自然な集団免疫閾値でピークを迎え、免疫力が衰えた可能性が高いため、ある程度のリスクを伴い、将来の感染を防ぐことにならないワクチン接種を義務付ける賢明さに疑問が生じます。
最終的に、2021年100月にCDCはプロビンスタウンで発生したアウトブレイクの調査結果を発表し、ワクチン接種を受けた患者とワクチン接種を受けていない患者の発生率が同じであったという、XNUMX％の免疫回避の議論の余地のない証拠を示しました。
2020年秋の自然集団免疫閾値とデルタ地帯における免疫回避という同じ理論は、将来のアウトブレイクは、比較的抑制されていないアウトブレイクで感受性の高い集団が枯渇し、免疫力が低下した集団が激減するという特徴的なタイムスケールを持つという理論につながりました。上の写真は、南アフリカの各州で発生したオミクロン・アウトブレイクが、米国各州で発生したオミクロン・アウトブレイクの特徴的なタイムスケールを定義している様子です。これもまた、私が辿ってきたこの理論的経路を裏付けています。
コロナウイルスの起源
思い出してください、COVID-19以前は、コウモリからヒトへの病原体のスピルオーバーと、病原体を宿主または発生源に帰属させる統計的手法を研究していました。アウトブレイク予測を終えた後、私は病原体のスピルオーバー、つまりこの生物学的因子がどこから来たのかをその発生源に帰属させるという問題に戻りました。
文献を読みましたが、不十分で、欠陥のあるデータ、欠陥のある分析、あるいは根拠のない仮定に基づいて、いつもとは違って強い結論を導き出していることに気づきました。私は、SARS-CoV-2の進化樹の根底にある二つの大きな枝は、二つのスピルオーバーイベントの証拠であると主張するPekarらの論文を批判する記事を書きました。著者らの手法では結論が正当化されず、さらに著者らは、SARS-CoV-2の進化樹の根底にある二つの大きな枝という前提を覆す配列を除外していることを示しました。これは人獣共通感染症起源論者の怒りを買い、私にも標的ができました。 プレプリントのコメントをよく読んで、一目見てみましょう。
私がヴァレンティン・ブリュッテルとトニー・ヴァンドンゲンと共同執筆した次の論文は、はるかに異端的なものでした。実験室起源説は、挿入されたとされるフーリン切断部位を軸に展開されましたが、コロナウイルスにフーリン切断部位を挿入するには、ウイルスのDNAコピーを作成する必要がありました。 SARS-CoV-2ゲノムの中に、コロナウイルスのDNAコピーを作成するための主流の方法と一致する証拠が見つかりました。
これもまた、 エコノミスト と同様 電報 などなど。しかし、いずれの場合も、これらのジャーナルは正統派の守護者たちが作り出した論争を煽り立てた。彼らは皆、この研究を行ったとされる武漢ウイルス研究所、あるいは2019年に武漢で発生したSARSコロナウイルスのDNAコピーにフーリン切断部位を挿入することを提案した研究者たちに2018年に資金提供していたことが判明した米国に拠点を置く保健科学助成機関であるNIAIDと密接な関係を持っている。
私の罰
一方、 最近の証拠は我々の理論を裏付けている新型コロナウイルスの流行と集団免疫の閾値に関する私の理論がサンプル外証拠によって裏付けられたのと同じように、裏付けだけでは学界への復帰を認めるには不十分なようです。意見の相違による有害な雰囲気、データ自体によって誤りが証明された有名教授たちの傷ついた自尊心は、有害で憤慨した正統派のコミュニティを生み出しました。私のような罪人には復帰の望みはありません。なぜなら、十分な闘いと傷ついた自尊心の後には、あらゆる委員会、あらゆる編集委員会、あらゆる会議委員会に、私の異端で傷つけた誰かが必ず存在するからです。
今、圧倒的な量のデータと証拠から自分たちの領域を必死に守ろうとする正統派の学者たちとの対話において、私は異端の緋色のアルファベットのレッテルを貼られている。 Aンティバックス、 Bロウストーンボーイ、コロナ対策、 Dエンニアリスト、などなど。私は物事を発見する洞察力と、それを貫く勇気を持っていたため、多くの社会ののけ者にされている。後輩が譲歩を拒むことほど、憤慨した先輩の自尊心を傷つけるものはない。まるで、私を殴り倒したボクサーの拳が折れた責任を私が負わされているかのようだ。
将来のキャリアを見つめ、どの道を選ぶべきか迷っている未来の科学者たちに、この道のりを共有したいと思いました。私がここで経験した岐路は、きっと他の人たちも経験することでしょう。あなたの専門知識を持つ人にしか見えない何かを見つけるかもしれません。そして、落胆や研究成果を共有しないよう勧められること、あからさまな敵意、そしてもし研究成果を共有したとしても、かつて同僚や友人だと思っていた人たちから疎外されることなど、あらゆる困難に直面するかもしれません。
あなたは正統派へと向かう道標を目にするでしょう。そして、異端の道へと続く、惨めで、化膿し、棘だらけの論争の藪を見下ろすでしょう。そして、当然ながら、緋色のHを背負いたくないという誘惑に駆られるかもしれません。もしあなたが、常に思い描いていたキャリアを維持したいのであれば、安らぎと仲間意識を求めるのであれば、絶対に自分の首を突っ込まず、物議を醸すようなことはせず、権力のある地位にある人々を批判してはいけません。あなたの肖像画が建物の廊下に掲げられるかもしれません。そして、あなたは、あなたを擁してくれたその建物、あるいは少なくとも物議を醸すようなことをしないことを選んだあなた自身への愛以外、何も知ることはないでしょう。
正統派の下り坂の道を離れ、異端の厳しい坂を登り始めたことは、確かに大きな変化をもたらしました。心の中では、私は今もなお、二酸化炭素に興味を持ち、光合成に魅了され、原子に畏敬の念を抱く母の子です。
異端の道を歩むことで、私は擦り傷や打撲傷を負い、殴られ蹴られ、叩かれ罵倒され、デジタルの晒し台に載せられ、顔に侮辱を浴びせられました。私はもう一度、同じことを繰り返したい。なぜなら、この道を歩むことでのみ、自分が何者なのかを発見できるからです。時が経てば、同じように自分の信念を貫く勇気のある他の人々に出会うでしょう。そして、異端の友人一人は、正統派の同僚100人よりも力強い味方です。風が吹き、雨が降る異端の丘の頂上で、あなたは最も聡明な知性を持つコミュニティ、信仰よりも帰属を優先する真の友人たちを見つけるでしょう。そして、殴られながらも笑い、攻撃されながらも強くなり、憎まれながらも愛することを学ぶでしょう。
異端の道を歩む過酷な道のりを同僚に勧めるつもりはありません。最も強く、最も聡明で、最も誠実で、最も勇敢な友人にだけ勧めます。もしあなたがその道のりを乗り越えることができれば、その先には自分の強みが見つかり、輝けるでしょう。
あなたは、自分の魂を彼らの掌中に収めようとした卑劣な者たちから軽蔑されるかもしれない。しかし同時に、あなたよりも先に現れた、称賛に値する異端の科学者たちからも称賛されるだろう。あなたは、純粋で束縛されない魂を持つ多様なコミュニティの中で愛され、尊敬されるだろう。たとえ意見が合わなくても、丁寧に、そしてあなたが私たちのコミュニティの一員であることを保証できる方法で。なぜなら、この丘の上の異端の街に追放された私たちほど、不寛容の腐食性を理解している者は少ないからだ。
著者からの転載 サブスタック
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Alex Washburne は数理生物学者であり、Selva Analytics の創設者兼主任科学者です。 彼は生態学、疫学、経済システムの研究における競争を研究し、covid 疫学、パンデミック政策の経済的影響、疫学ニュースに対する株式市場の反応に関する研究を行っています。
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